当前，陕西苹果产业发展正在过大关、迈大坎，面临一系列新的矛盾和问题。具体来讲，主要集中在3个方面。

    一是关于全省苹果树的换代问题。陕西苹果产业之所以得到蓬勃发展，一个重要原因是抓住了我国传统产区果树换代的机遇，今天陕西自身也遇到了这个问题。据测算，陕西全省未来10年有400万亩乔化老果园需要更新改造，未来20年全部果园需要更新改造。因此作为苹果产业发展的关键因素，培育优质苗木尤为重要。当前，尽管各级财政对果业科研投入的力度逐年加大、资金有所增加，但仍低于发达国家产区水平,果业基础研究和创新研究比较薄弱，优质苗木研发和繁育严重滞后于产业需求。同时，由于多年高密度种植和透支式经营，陕西省果园土壤有机质不断减少，苹果单产仅相当于发达国家的三分之一。

    二是关于产业转型升级问题。苹果产业是由生产、加工、流通、科研、品5个基本要素构成的，世界发达国家已基本实现加工品种专用化、原料基地化、质量体系标准化、经营公司化。而陕西省果品加工结构单一，产品以果汁为主，粗加工产品多，果品加工增值能力不足。据统计，陕西省苹果加工产值与采收产值的比例仅为1.56:1，远低于美国3.7:1、日本2.2:1的水平。另外，冷链建设还比较滞后，发达国家果品冷藏能力达到总产量的80%，陕西省仅为30%，高标准气调库仅占总冷藏能力的20%左右、苹果总产的6%左右；国外果品采后商品化处理率近100%，陕西省不足10%；欧美国家农产品冷运率高达90%、腐损率不超过5%，我国分别约为10%和35%，而陕西省这两项指标尚不及平均水平。

    三是关于经营体制问题。陕西省果业普遍以小农户经营为主，“大产业、小果园”“大市场、小果农”的现象比较普遍。涉果企业大部分为中小型企业，上规模、有影响和带动力的龙头企业较少，省级以上龙头企业仅占企业总数的2.6%。另外，苹果品较多、各自为战，果业品影响力与果业大省的地位不相称。特别是现代营销体系亟需建立，比如，日本青森县年产苹果90%以上在批发市场拍卖销售，美国一半以上的鲜活农产品通过批发市场进入零售域，荷兰出口花卉大多通过阿司米尔拍卖市场销售出去。而陕西苹果销售普遍通过区域性市场和田间地头完成，60%至70%的苹果靠经纪人、合作社、专业大户等传统手段营销，网上销售、电子交易、物流配送等现代化手段的运用比较滞后。