1、端天气是造成红富士苹果果锈的主要因素：春季温度低，或出现倒春寒，使花期推迟；特别是遇寒冬的年份，果树来不及进行越冬锻炼，树体的抗逆能力下降，花芽的后期发育受到影响；开花前后的霜冻低温，也会严重损伤花器和幼果。受损的幼果表皮细胞韧性差，果点皮孔的耐涨压力减弱，易引发果锈和双环锈。
2、红富士苹果套袋前喷药不当：保证幼果常态生长，减少外源刺激才能减少果锈。套袋前的药剂选择和喷药技术至关重要，谢花80%时就要喷药保护，受病虫侵染和外界环境的侵蚀。
药剂选择以安全性好的微乳剂、悬浮剂、水乳剂和水分散粒剂为主，忌用乳油类、铜制剂、砷硫制剂和粗制代森锰锌类药物，内吸+保护+营养疫。
喷药要求匀、均、透。细喷片、远距离、少刺激，药量要足，不漏喷。花后、二遍药务必将红蜘蛛、绿盲蝽、小卷、绵蚜、康氏粉蚧彻底控制。套袋前的第三遍药，种类宜少不宜多，避药剂间交叉反应；含氨基酸的叶面肥应放在套袋后补用。喷药二天后再行套袋，才能减药物刺激产生果锈。
慎用唑类杀菌剂。三唑类杀菌剂种类较多，剂型不同，选用不当易造成抑制果个生长和隐性药锈的不良后果。隐性药锈常发生在生长后期的8月中下旬～9月，多雨年份表现更重。三唑类药物安全性好的12.5%腈菌唑微乳剂和苯嘧甲环唑，不抑制生长，无隐形药害，其他唑类杀菌剂应安排在开花前和套袋后适期选用。
3、红富士苹果果袋质量差，套袋技术差：劣质果袋吸湿性，疏水性差，遇雨即湿，长期吸附果面，果实长期浸泡在阴暗潮湿的环境里，和蒸气浴一样，幼果皮孔发汗撕裂。套袋操作扎口不严，雨水药水随袋口侵入，袋底的透气孔小而不开张，水积蓄袋中，使果皮细胞角质层龟裂，皮孔果点放大木栓化，成为果锈。阴雨天气是加重果锈发生的重要诱因。
4、红富士苹果树体郁闭：干低枝多，通风透光不畅，套袋后更加剧了树体遮光，像原始森林一样密不透风。阴暗潮湿少光照，水锈果锈多而重。
5、红富士苹果夏季膨果肥过多使用高氮肥料：7-8月份的膨果肥，目的是膨大果个，但选用高氮肥和含氮量高、激素多的冲施肥，短期速效，爆发力，使果肉和果皮生长速率不同步，表皮细胞破裂，产生果锈。6月份以后追施纯氮肥越多，果锈发生越重。
6、红富士苹果环剥重，烂根多，树势弱：过重的环剥、环割，树势急剧衰弱，根系枯死严重，养分的缓冲能力弱，地下树上生长不协调，面黄肌瘦，果锈随之加重。
